بررسی برهمکنش بین اسیدآمینه های هیستیدین و آسپارتیک اسید در ساختار نوع دوم صفحه ای بتا از دیدگاه نظریه تابعی چگالی
پایان نامه
- دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد مرودشت - دانشکده علوم پایه
- نویسنده حمید حمیدیان
- استاد راهنما محسن سرگلزایی مریم بهادری
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1392
چکیده
چکیده: انتقال پروتون، بین شاخه های جانبی اسید آمینه در محاسبات تیتراسیون پروتئین و محاسباتpka پروتئین، نقش دارند لذا دانستن مکانیسم انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسید های امینه از اهمیت خاصی برخوردار است. در این تحقیق با استفاده از روشهای محاسباتی (روش b3lyp وتابع پایه 6-311++g** ) مکانیسم انتقال پروتون و تشخیص حالت وا سط بین اسیدآمینه های هیستیدین، وآسپارتیک اسید، مورد بررسی قرار گرفت،و ویژگیهای ساختاری که شامل طول و زوایای پیوندی مولکولهای مذکور می باشد، بدست آمد. و همچنین با استفاده از محاسبات ترمودینامیکی، ثابتهای سرعت و ثابت تعادل در فاز گاز و محلول وهمچنین pka بدست آمد. کلمات کلیدی: هیستدین،آلانین، آسپارتیک اسید، انتقال پروتون، dft ،b3lyp
منابع مشابه
بررسی برهمکنش بین اسیدآمینه های لیزین و گلوتامین در ساختار نوع دوم صفحه ای بتا از دیدگاه نظریه تابعی چگالی
چون انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسید آمینه در محاسبات تیتراسیون پروتئین ومحاسبات pka نقش دارند، لذا دانستن مکانیسم انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسیدهای آمینه از اهمیت خاصی برخوردار است. در این تحقیق با استفاده از روشهای محاسباتی(روشb3lyp وتابع پایه ?????????) مکانیسم انتقال پروتون وتشخیص حالت واسطه بین اسید آمینه های لیزین وگلوتامیک اسید مورد بررسی قرار گرفت و ویژگیهای ساختاری که شامل ...
15 صفحه اولبررسی تکینگی PrBa2Cu3O7 در قالب نظریه تابعی چگالی
In order to study some theories about nonsuperconductivity of PrBa2Cu3O7, based on the density functional theory and with APW+lo/LAPW method some calculations for PrBa2Cu3O7 (Pr123) and YBa2Cu3O7 (Y123) were performed. The LSDA+U approximation was used for Pr(4f) orbitals and the effect of changing UPr on the band structure, Pr(4f)-DOS, distribution of electrons on the planes and chains, and ...
متن کاملمحاسبه خواص مکانیکی و ترمودینامیکی ساختار 3C کربید سیلیکون با استفاده از دینامیک مولکولی و نظریه تابعی چگالی
کربید سیلیکون به خاطر خواص فوق‌العاده مکانیکی، فیزیکی، ترمودینامیکی و شیمیایی، یک سرامیک بسیار جذاب برای اکثر صنایع است. در این پژوهش خواص مکانیکی و ترمودینامیکی ساختار C3 کربید سیلیکون با استفاده از شبیه‌سازی‌های دینامیک مولکولی و نظریه تابعی چگالی مبتنی بر تقریب شیب تعمیم یافته در دما و فشارهای بالا محاسبه و جهت صحت با نتایج تجربی موجود مقایسه شده است. محاسبات دینامیک مولکولی با استفاده از پت...
متن کاملگاز الکترونی برهمکنش دارو نظریه ی تابعی چگالی
در این پایان نامه سیستم های گاز الکترونی برهم کنش دار مورد بررسی قرار می گیرد. با توجه به این که بحث ، مربوط به یک سیستم بس ذره ای است و در این حالت حل معادله ی شرودینگر برای چنین سیستمهای بس ذره ای به سادگی مقدور نیست ، باید از زوش های تقریبی کمک گرفت . روش های هارتری (h) و هارتری فوک (hf) و مهمتر از همه نظریه ی تابعی چگالی (dft) روشهای مورد بررسی ما در این رساله می باشند. اهمیت نظریه ی تتابعی...
15 صفحه اولبررسی نظری ناخالصی‌های نیکل و طلا بر خواص الکترونیکی گرافین با استفاده از نظریه تابعی چگالی
در این مقاله، خواص الکترونی گرافین در حضور وغیاب ناخالصی‌های نیکل و طلا با استفاده از روش نظریه تابعی چگالی بررسی می‌شود. در تمامی موارد با استفاده از نتایج به دست آمده ساختار الکترونی، چگالی حالت‌ها، پایداری، گاف انرژی و گشتاور مغناطیسی مطالعه شده است. محاسبات ما با استفاده از نرم افزار SIESTA انجام شده و از تقریب‌های GGA و LDA برای پتانسیل تبادلی- همبستگی استفاده شده است. با افزایش اندازه‌ی م...
متن کاملبررسی ساختار نواری اکسیدهای کووالانسی در چارچوب نظریه تابعی چگالی
دی اکسیدهای گروه iva (sio2, geo2, sno2, pbo2) ازگاف نواری پهن و ثابت دی الکتریک بالایی برخوردارند. این مواد به دلیل ویژگی های شیمیایی، مکانیکی و خواص دمای بالای برجسته ای که دارند همواره مورد توجه بوده اند. این ترکیبات همچنین از نقطه نظر ژئوفیزیکی مهم هستند و خواص الکترونی¬شان به طور وسیعی از عایق به فلز تغییر می کند. در این مطالعه نظر به اهمیت و کاربرد اکسیدهای کووالانسی در صنایع و بالا بودن ش...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد مرودشت - دانشکده علوم پایه
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023